אי הכלבים" מביא את סיפורו של אטארי קובאיאשי בן ה 12, המקורב לראש העיר המושחת קובאיאשי. כאשר, על ידי צו מינהלי, כל הכלבים של העיר מגאסאקי מגורשים לאתר עזוב של זבל, אטארי חוטף מטוס ומגיע לאי הזבל כדי למצוא את כלבו האהוב. שם, יחד עם להקת כלבים נועזת יוחלט עתידו של חברו הטוב של האדם.